De nombreux systèmes autonomes en site isolé utilisent plus d'une source d'énergie et sont donc appelés systèmes hybrides. La plupart des systèmes hybrides associent l'énergie photovoltaïque avec l'éolien et un groupe électrogène dans le cas d'un système avec option back-up. Les systèmes hybrides assurent un approvisionnement continu en électricité fiable. De plus, ils fournissent une quantité suffisante d'électricité permettant de répondre aux besoins domestiques modernes (éclairage, communication, réfrigération, approvisionnement en eau) ainsi qu'aux services publics (centres de santé, écoles) et au développement d'une économie locale (petites industries et services associés tels que les antennes télécoms et systèmes d'irrigation). Les systèmes hybrides peuvent également être utilisés pour la fourniture centralisée d'énergie des villages en alimentant un mini réseau.